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从开始出兵到攻克延平，前后历时仅四个月，朱元璋便消灭了盘踞在福建十几年的陈友定，一举扫清了后续平定两广的障碍。
平定两广的战略也是和南征福建一样，兵分三路：
第一路军由杨璟、周德兴统率，从湖南向南攻略广西，目标是围攻广西首府靖江；
第二路军由陆仲亭统率，从韶州（今广东曲江）直捣德庆，目标是切断两广之间的联系；
第三路军则是之前平闽的水师，由廖永忠统率，从水路进攻广州，之后相机支援第一路军或第二路军。
第一路军于吴元军（元至正二十七年，公元1367年）十月出发，第二、三路军则是于明洪武元年（公元1368年）二月出发。
相比第二、三路军，第一路军所遭遇的抵抗是最为顽强的。在第一路军从湖南到广西的进军路线上，有两个经过激烈血战才攻占的城池，一个是永州（今湖南永州），一个是全州（今广西全州）。
在这两个地方，第一路军经历了一番生死苦战。在敌军的漫天箭雨中，第一路军成片成片的士卒倒下，然后一批又一批的士卒顶上继续攻城。在震耳欲聋的拼杀声中，死伤士卒的鲜血逐渐汇聚在一起，形成了一条令人胆寒的血河。
但是，在这么艰苦的战斗下，朱元璋的南征大军中没有一个士卒成为逃兵，一则因为严厉军法会约束，二则因为熊熊斗志已点燃。在打败陈友谅、张士诚、方国珍、陈友定之后，朱元璋的部队已然是这个时代最强大的军队，这既是信心，也是事实。
在士卒们的奋力拼杀下，守城的敌军被杀得片甲不留，没有一个活口。这极为震撼了后续那些妄想负隅顽抗的城池，使得后续进军顺畅起来了。第一路军在攻克全州之后，进围广西首府靖江（今广西桂林）。之后，只要攻破靖江，那么就能迅速平定广西。
第二路军在开战之后，行军迅猛，在短短三个月的时间里便占据了广东北江、西江三角地带，将这里的敌军全部歼灭，隔断了广州与靖江之间的一切交通，为第一路军的围城之战做了有力策应。
第三路上则是有如神助，进军之后顺风顺水，不费吹灰之力便斩获了巨大的战果。廖永忠统率水师沿着海岸线南下，在大军到潮州之前，他便派遣使者劝降元朝江西分省左丞何真，用实力逼迫何真做出正确选择。
等到廖永忠的水师到潮州之后，何真已然做出了对自己最合适的选择，他打开城门，恭迎王师进城，献上印章、图籍、户口，奉表归附，潮州不战而下。
在廖永忠的有意宣传之下，潮州投降的消息在广东境内迅速传播，使得人心浮动，原本打算坚守城池的元朝官员纷纷奉表归附，因此广州附近的州县也不战而下，广东已然平定。
之后，廖永忠率领水师沿着西江进入广西，北上与第一路军会合，共同围攻靖江。在第一路军和第三路军的优势兵力之下，靖江很快就坚持不住了。
两个月后，也就是洪武元年（公元1368年）六月，南征大军杀入城中，靖江城破。到七月时，如同秋风扫落叶一般，朱元璋的南征大军将广西境内的所有抵抗势力全部消灭。自此，两广地区尽归朱元璋所有，纳入他的版图之中。
福建和两广平定后，中国南方除了四川和云南尚未平定之外，其他省份都连成一片了，成为支撑北伐大军的坚固大后方。自此，北伐大幕徐徐拉开，开启了波澜壮阔的一统华夏之旅。